Fondée en 1962, la FFPE s'est donné comme but de défendre les intérêts de tous les agents des Institutions européennes et de promouvoir l'indépendance et l'excellence de la Fonction publique européenne.
La FFPE est présente dans la plupart des Institutions.

La FFPE est une organisation professionnelle totalement indépendante des partis politiques et des groupes de pression ; elle adhère à un esprit syndical moderne, qui dépasse les relations conflictuelles entre employeur et employé.